10.3969/j.issn.1001-9448.2011.02.013
食管鳞癌相关基因功能及其相互作用研究
目的 研究食管鳞癌相关基因功能及相互作用,探讨食管癌分子机制.方法 从GEO下载食管鳞癌基因芯片数据集,应用BRB-ArrayTools和网络在线工具进行数据挖掘,寻找食管鳞癌与正常组织差异基因、对差异基因进行功能分析和相互作用分析.结果 得到262条差异基因,上调基因主要涉及DNA复制、细胞周期、蛋白丝氨酸/酪氨酸激酶活性等;下调基因主要涉及凋亡、分化、免疫与炎症反应、细胞骨架等.有49条差异基因相互紧密联系,构成相互作用网络,其中19条基因参与细胞周期,特别是中心体的调节;22条基因参与细胞基质形成和细胞交流;8条基因主要参与亚油酸、花生四烯酸代谢.结论 食管鳞癌存在多个相互紧密联系的基因表达异常,特别是分裂期中心体调节、肿瘤与微环境的关系、亚油酸和花生四烯酸代谢等方面.
食管鳞癌、基因芯片、分子相互作用、数据挖掘
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R91;R39
河南省教育厅自然科学基金资助项目2010B360004
2011-03-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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169-171