联合分析HCV种属信息区和高度保守区序列确定广东地区HCV基因型和亚型

摘要：

目的 扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5-UTR基因序列,用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型,阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点.方法 采集99例慢性丙型肝炎病例血清,应用RT-PCR技术分别扩增HCV NS5B区和5-UTR特定片段,测序后进行系统进化树分析,确定HCV基因型及亚型.结果 99例患者标本均准确分型,其中NS5B区段分型74例,5-UTR区段分型99例.HCV基因型和亚型的分布:1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例;另有2例标本在两区段分型不同,5-UTR /NS5B区段分型分别为6a/1b和3a/1b.两区段共同分型74例,72例标本在两区段基因型一致,2例标本在两区段基因型不同,为HCV重组体.结论 联合分析HCV不同区段基因序列,可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性.广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为6a和2a;3型中的a、b亚型也占有一定比例.

关键词：丙型肝炎病毒、基因型、亚型、系统进化树分析

所属期刊栏目：31

分类号：U49;TN

资助基金：国家自然科学基金项目30771899

在线出版日期：2010-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：825-828