Tau蛋白R2/wt片段形态受渗透剂影响机理的分子动力学模拟

摘要：

采用分子动力学模拟研究了在尿素与氧化三甲胺(Trimetlylamine oxide,TMAO)作为渗透剂的情况下对无序蛋白Tau蛋白第二重复片段(R2/wt)的折叠与构象的影响,统计分析了该片段周围的氢键强度分布、 水分子流动性与水结构的分布,并与在纯水环境下的结果进行了比较.结果表明,无渗透剂存在下的R2/wt片段能形成长时间稳定的首尾相连的发卡结构,且肽链形成的分子内氢键数量较高,在R2/wt片段周围的水分子的流动性较高.当尿素作为渗透剂时,R2/wt的分子内盐桥难以形成,肽链以完全展开的构象为主,R2/wt周围水分子之间以及水分子与肽链的氢键作用被削弱,其周围水分子的流动性降低,结构化程度高的水分子比例降低;当TMAO作为渗透剂时,R2/wt片段只能形成不稳定的发卡结构,且容易向展开态转变,肽链周围的氢键分布和水结构分布与无渗透剂相比无明显变化,但肽链周围水分子的流动性同样降低.加入渗透剂能改变R2/wt片段的形态分布模式,并进一步改变肽链与水分子的氢键、 水结构与流动性性质,此结果为调节该片段的聚集行为提供了指导.

关键词：Tau蛋白、渗透剂、蛋白质折叠、水结构、氢键

所属期刊栏目：44

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：226-233