二芳基乙烯衍生物与DNA结合的分子动力学研究

摘要：

基于分子动力学方法,对2种旋转异构的二芳基乙烯(DTE,dithienylethene)衍生物(DTE1和DTE2)与不同分子结构DNA结合过程的热力学与动力学特征进行模拟,结果发现,DTE1,DTE2与DNA分子采用小凹槽结合(MiGB)的模式结合时所需能量最低,存在的分子间库仑能与范德华相互作用能最小,说明该结合模式最稳定;由于空间位阻作用,互为旋转异构体的2个DTE衍生物与DNA作用表现出截然不同的结合行为,DNA对DTE衍生物具有明显的对映异构体选择性;DTE衍生物与DNA分子作用位点的选择性直接与构成位点的碱基对相关.

关键词：分子动力学模拟、手性药物、二芳基乙烯衍生物、DNA、旋转异构体、结合模式

所属期刊栏目：40

分类号：O641.3(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金21475044;国家科技支撑项目2015BAK44B00;中央高校基本科研专项资金222201817022;国家留学基金201706745036

在线出版日期：2019-06-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1229-1235