水溶液中氨基酸侧链对G︰C碱基对间氢键影响的理论研究

摘要：

利用量子化学方法研究了气相和水溶液下,氨基酸侧链与鸟嘌呤和胞嘧啶间的氢键作用.应用B3LYP/6-31+G( d,p)方法优化复合物几何结构,使用MP2/aug-cc-pVDZ方法进行复合物能量、自然键轨道( NBO)电荷和二阶稳定化能的计算.结果表明,水溶液可使氨基酸侧链与碱基或碱基对之间氢键键能显著减小；带电复合物气相和水溶液氢键键能之差范围为50.63~146.48 kJ/mol,中性为0.17~24.94 kJ/mol；电荷的转移量与氢键键能成正比,电荷转移量越多,复合物越稳定；二阶稳定化能与氢键键长成反比,与电荷转移量成正比,且气相与水溶液氢键二阶稳定化能之比约为两相的电荷转移量之比.水溶液对该类体系中氢键作用具有明显影响.

关键词：氨基酸侧链、鸟嘌呤、胞嘧啶、氢键、自然键轨道电荷

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分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金重点项目21133005,21473083;辽宁省教育厅一般项目L2014426;辽宁师范大学实验室开放项目批准号:cx20160111资助. Supported by the Key Project of National Natural Science Foundation of China.21133005,21473083;the General Project of Educa-tion Department of Liaoning Province, ChinaL2014426;the Laboratory Opening Program of Liaoning Normal University, Chinacx20160111

在线出版日期：2016-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1686-1693