新型鸭肝炎病毒FS株全基因组序列分析

摘要：

本试验参考GenBank中已公布的新型鸭肝炎病毒全基因组序列,应用Primer Premier 5.0软件,在序列保守区域分别设计了7对引物,通过RT-PCR方法对本实验室已鉴别纯化的新型鸭肝炎病毒FS株进行了分段扩增,经过测序拼接整理,获得FS株全基因组序列(GenBank中登录号为EU877916).序列分析表明,FS株全长7792个碱基,一个大的开放阅读框编码2251aa.将各基因与国内外已发表的新型鸭肝炎病毒参考毒株进行相似性分析,结果表明,与G株(GenBank登录号为EU755009)核苷酸相似性最高,为99.2%,而FS株与G株和C-GY株(GenBank登录号为EU352805)的氨基酸相似性最高,均为99.6%,与DHV-HS株和DHV-HSS株的相似性最低,均为83.6%.系统发育树分析发现,与G株亲缘关系最近.

关键词：新型鸭肝炎病毒、全基因组、序列分析

所属期刊栏目：34

分类号：S858.32(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金30871877

在线出版日期：2009-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：34-38