菜心群体中AUF2基因的遗传变异及其与农艺性状的关联分析

摘要：

[目的]通过检测Auxin Up-regulated F-box protein2(AUF2)基因在菜心群体中的自然变异,挖掘其优异等位基因,为菜心分子辅助育种提供理论参考.[方法]采用PCR扩增后直接测序的方法,检测AUF2 基因在 156 份菜心种质材料中的自然变异,利用Tassel 5.0 软件的混合线性模型(MLM)对AUF2 基因的变异位点与菜心群体的株高、单株质量、最大叶长、最大叶宽、最大叶柄长和叶绿素含量(SPAD)等 6 个农艺性状进行关联分析,以期发现显著影响菜心农艺性状的变异位点,并确定其优异等位变异及单倍型.[结果]经测序分析,在AUF2 基因的 2996 bp扩增区域内共检测到 34 个变异位点,构成 36 个单倍型,表现出较高的核苷酸多样性(π = 0.00503)和单倍型多样性(Hd = 0.780),其上游非编码区 1498 bp内含 26 个SNP和 2 个InDel位点,编码区960 bp内含5个SNP和1个InDel位点,而下游非编码区538 bp范围没有检测到变异位点.中性检验显示,AUF2基因在群体中的Tajima's D值、Fu and Li's D*值和Fu and Li's F*值均为正值,且显著偏离中性选择,可能是群体平衡选择的结果.经关联分析发现,4 个SNP位点与菜心的单株质量、最大叶长、最大叶宽和最大叶柄长等 4 个农艺性状呈显著相关性,其表型解释率在 5.04％～6.52％范围;4 个优异等位变异构成的单倍型Hap2 能显著增加菜心的单株质量,极显著地提高最大叶柄长的长度.[结论]AUF2 基因在菜心群体中存在丰富的变异,对菜心的部分农艺性状有显著影响,其优异等位变异和单倍型将有利于菜心品种的遗传改良.

关键词：菜心、AUF2 基因、多态性、农艺性状、关联分析、优异等位位点

所属期刊栏目：50

分类号：S634.5(蔬菜园艺)

资助基金：广州市科技计划项目;广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目

在线出版日期：2023-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：33-41