基于eDNA技术的珠海外伶仃海洋牧场细菌多样性研究

摘要：

[目的]探索珠海外伶仃海洋牧场微生物群落组成、序列数、生物多样性等,分析eDNA技术的灵敏度,为珠海外伶仃海洋牧场生态系统管理维护提供参考.[方法]2021年9月在珠海外伶仃海洋牧场设立9个站位点,在表层水下2 m处采样,并对样品进行预处理、DNA提取、PCR扩增、高通量测序,分析微生物种类组成、微生物资源密度和丰度,确定优势种.[结果]通过eDNA技术共检出珠海外伶仃海洋牧场微生物30种,隶属于5门7纲14目19科26属,共检测出779706个OTU(Operational Taxonomic Units).变形菌门为绝对优势门(占75.06％),其次分别是拟杆菌门(占11.35％)、厚壁菌门(占5.28％)、浮霉菌门(占1.91％)、放线菌门(占1.06％);优势种共有7种,分别是交替假单胞菌、海杆菌、莫拉克氏菌、嗜冷菌、溶藻弧菌、嗜盐单胞菌、鞘氨醇杆菌,其中溶藻弧菌优势度最高(0.19)、为绝对优势种,其次是交替假单胞菌和莫拉克氏菌,优势度分别达到0.13、0.12,为主要优势种.[结论]研究结果揭示了珠海外伶仃海洋牧场的微生物群落信息,探索了eDNA技术在海洋牧场的应用,印证了该技术的高效性和灵敏度,为海洋牧场微生物方面的研究提供基础数据和科学参考.

关键词：eDNA、海洋牧场、多样性、PCR扩增、微生物、优势度

所属期刊栏目：50

分类号：Q933(微生物学)

资助基金：广东省重点领域研发计划项目;中国水产科学研究院南海水产研究所基本科研业务费专项;中国水产科学研究院基本科研业务费专项

在线出版日期：2023-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：67-75