广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传变异分析

摘要：

[目的]监测2021年广东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus,PRRSV)的分子流行动态,为PRRSV综合防控措施的制定提供参考.[方法]在广东省内不同地区PRRSV检测为阳性的37个规模猪场采集521份患病猪组织样本进行PRRSV检测.对样本进行ORF5基因测序,采用DNAStar分析ORF5核苷酸的同源性及其推导氨基酸的同源性,并用Mega7.0构建基于ORF5基因的系统遗传进化树.[结果]从37个猪场采集的样品PRRSV阳性率为24.4％,猪场阳性率为45.9％.通过测序分析获得17株来自不同猪场的PRRSV ORF5基因序列,遗传进化分析表明所有毒株均属于北美毒株(PRRSV 2),其中有5株属于Lineage 8(JXA1-like和CH-1a-like)谱系,9株属于Lineage 1(NADC30-like和NADC34-like)谱系,3株属于Lineage 3(QYYZ-like)谱系,没有监测到Lineage 5(VR2332-like)谱系的毒株.17株PRRSV毒株的ORF5基因之间核苷酸序列同源性为81.3％～99.5％,推导的氨基酸序列同源性为80.0％～98.3％.[结论]2021年广东省PRRSV流行株以Lineage 1(NADC30-like和NADC34-like)和Lineage 8(JXA1-like和CH-1a-like)谱系为主,占比分别为52.94％和29.41％,Lineage 3(QYYZ-like)谱系降为次要流行株,占比为17.65％.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、ORF5基因、NADC30毒株、NADC34毒株、遗传变异

所属期刊栏目：49

分类号：S852.65+9.6;Q75(动物医学（兽医学）)

资助基金：广东省动物疫病野外科学观测研究站项目;广东省重点领域研发计划项目;广东省农业科学院院长基金项目

在线出版日期：2022-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：97-105