几条热点DNA条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力比较

摘要：

[目的]比较ITS2、ITS、psbA-trnH、rbcL、matK序列对海南大戟科植物的鉴定能力.[方法]利用PCR测序法对供试样本目的片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析.[结果]5条候选序列的序列获得率分别为86.96％、76.81％、89.86％、79.71％、49.28％;ITS2序列的变异系数和信息位点系数最大;ITS2序列存在明显的barcoding gap,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势.ITS序列虽存在barcoding gap,但种内变异和种间变异有较多的重叠区;psbA-trnH和matK序列barcoding gap均不明显,同时种内变异和种间变异有较多的重叠区;rbcL序列虽barcoding gap不明显,但种内变异和种间变异重叠比例较小.[结论]ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,rbcL序列不能作为单独的条形码鉴定物种,但可以作为ITS2的补充条形码.

关键词：大戟科、DNA条形码、ITS2、rbcL、鉴定

所属期刊栏目：46

分类号：S567(经济作物)

资助基金：海南省自然科学基金813190

在线出版日期：2019-12-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：27-33