黄瓜Ca2+家族序列特征及其表达特性分析

摘要：

通过黄瓜基因组数据库,采用生物信息学方法获得15个黄瓜Ca2+家族序列,并对其染色体位置、基因组位置、氨基酸长度、转录起始位点和Pfam匹配结构域数进行预测;利用RT-PCR方法对所有搜索到的Ca2+家族基因进行组织特异性分析;对黄瓜植株进行低温处理,分析黄瓜Ca2+基因家族的表达情况.结果显示:15个基因中除Csa021245未定位以外,其余均匀分布在1～6号染色体上,一致性为47.67％;Csa001688、Csa009857和Csa009360等3个基因的5'区出现CpG岛结构;组织表达特异性分析结果显示,Csa001688、Csa006826、Csa010172和Csa016434在叶中表达量最高,Csa003758、Csa010172和Csa018949在根中表达量最高;进化树分析结果显示,只有Csa010172和Csa009360与拟南芥AtACA2亲缘关系最近,这些基因可能在Ca2+家族信号传导过程中起着主要作用;实时定量表达分析表明,Ca2+基因家族参与黄瓜对低温胁迫的应答.

关键词：黄瓜、Ca2+家族、组织特异性、信号传导

所属期刊栏目：44

分类号：S642.2;Q786

资助基金：哈尔滨市科技攻关计划项目2006HE6BE052

在线出版日期：2017-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：61-66,封2