螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析

摘要：

在NCBI基因组数据库中可检索到3个钝顶螺旋藻藻株、1个极大螺旋藻藻株、1个盐泽螺旋藻藻株和1个螺旋藻属未定种的藻株基因组序列.6个螺旋藻基因组序列来源的糖苷酶基因共计32个,编码蛋白含260～1 084个氨基酸,BLAST序列比对显示,与非螺旋藻种属来源的已知序列的相似性在49％ ～ 84％之间.系统进化分析表明,32个糖苷酶基因聚类成8个簇,另有3个基因分别单独构成进化分支.酶学功能预测显示,这些糖苷酶基因分别属于8个糖苷酶家族(GH3、GH9、GH13、GH23、GH25、GH38、GH57、GH104),具有8种糖苷酶催化活性(纤维素酶、溶菌酶、α-甘露糖苷酶、α-淀粉酶、普鲁兰酶、1,4-α-葡聚糖分支酶、肽聚糖结合功能、β-葡萄糖苷酶).

关键词：螺旋藻、基因组、糖苷酶

所属期刊栏目：43

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：海南省科技兴海专项2015XH04;广东省海洋渔业科技与产业发展专项A201501C09

在线出版日期：2017-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：115-121