牙鲆精氨酸酶基因片段的克隆及序列分析

摘要：

根据GenBank中虹鳟、大菱鲆、斑马鱼及其他生物的精氨酸酶基因序列设计并合成一对引物,并提取变态期牙鲆仔鱼总RNA作为模板进行RT-PCR,得到一条eDNA片段.将产物连接到T载体中,转化、扩增重组质粒.提取大肠杆菌中的重组质粒进行DNA测序.将DNA测序所得到的基因序列翻译成蛋白序列和已知的大菱鲆、鲤鱼、虹鳟、斑马鱼的精氨酸酶基因序列进行同源性分析.结果显示,利用RT-PCR的方法扩增出一条284 bp的目的基因片段,比对结果发现,其与大菱鲆、鲤鱼、斑马鱼以及虹鳟精氨酸酶基因蛋白序列的同源性分别为96％、85％、84％和82％.对蛋白序列进行生物信息学分析发现,整个蛋白序列中无信号肽,无糖基化位点,无跨膜结构域,但含有一个典型的arginase结构.在N-端第38～44、57 ～ 64、71～ 76、89～ 94区段有β-折叠中心;第7～18、50 ～ 52、81～87区段可能形成α螺旋区域.Arg蛋白N端第37～ 45和第74～ 77区段为优势抗原表位区域.

关键词：牙鲆、精氨酸酶、克隆、序列分析

所属期刊栏目：43

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金30271017;国家高等教育博士项目科研基金20040264001

在线出版日期：2017-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：108-114