杜洛克猪生长性状全基因组关联分析

摘要：

对猪全基因组高密度SNP基因型数据及生长性状表型数据进行全基因组关联分析,以期找到影响这些性状的候选基因,更准确地了解这些生长性状的遗传基础.利用Illumina猪60K SNP芯片对191头杜洛克猪进行基因型检测,使用R语言环境下GenABEL软件包提供的单标记回归分析模型,对体重达100 kg日龄(D100)、活体背膘厚(BFT)和活体眼肌面积(LMA)3个生长性状的表型分别进行全基因组关联分析.在D100和LMA2个性状中分别检测到1个基因组水平和6个染色体水平显著关联的SNP,均位于5号染色体;没有检测到与BFT显著相关的SNP.生物信息学分析表明,BTG1和EFCA B6可能是影响生长性状的重要候选基因,但其功能有待进一步研究确认.

关键词：猪、全基因组关联分析、候选基因、生产性状

所属期刊栏目：41

分类号：S828.2;Q343.1+5(家畜)

资助基金：国家现代农业生猪产业技术体系建设专项资金CARS-36;国家自然科学基金31200925;教育部博士点基金20124404120001;广东省自然科学基金S2012040007753;广州市科技攻关项目11A62100441;广东省研究生教育创新计划项目2013JDXM12

在线出版日期：2014-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：139-143