条斑紫菜海藻酸盐裂解酶的生物信息学分析

摘要：

为了了解条斑紫菜海藻酸盐裂解酶PyAly(Porphyra yezoensis alginate lyase)的结构与功能,试验通过生物信息学方法分析其理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、结构及进行多序列比对,并将建模得到的结构进行分子动力学模拟.结果 表明:PyAly为亲水性蛋白,N端1-25位为信号肽,下游区域位于胞内,二级结构中无规则卷曲和α-螺旋占比较高,三级结构具有明显β-jellyroll结构,属于PL-7蛋白家族,尚未发现与其同源性较高的真核生物来源蛋白,活性位点处的保守氨基酸残基对其功能的发挥具有重要作用.优化后的蛋白结构较为合理,可为PyAly酶解机理研究奠定基础.

关键词：海藻酸盐裂解酶、条斑紫菜、生物信息学、分子动力学

所属期刊栏目：47

分类号：TQ(化学工业)

资助基金：福建省教育厅A类项目;食品软塑包装技术福建省高校工程研究中心开放基金项目

在线出版日期：2020-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：11-13