3个生长温度的家蝇幼虫转录组和表达谱分析

摘要：

目的:通过3个不同生长温度的家蝇幼虫表达谱差异分析,为进一步探究温度引起的家蝇幼虫转录组变化提供实验数据.方法:提取3个生长温度(18℃、28℃、38℃)4龄期家蝇幼虫总RNA,反转录成cDNA,进行Illumina测序、de novo组装及生物信息学分析.结果:对3个不同生长温度的家蝇幼虫转录组测序组装共得到43,570个Unigene,分别将18℃和38℃培养的家蝇幼虫转录组与28℃培养的家蝇幼虫转录组进行比较,筛选到10,863个和11,606个差异表达基因,其中共同上调的差异表达基因有1,994个,共同下调的差异表达基因有3,640个.对差异基因进一步GO功能显著性富集分析和KEGG通路分析显示,这些差异表达基因主要细胞、细胞组分、代谢过程有关.

关键词：家蝇幼虫、转录组、数字基因表达谱

所属期刊栏目：45

分类号：T384.2

资助基金：广东省自然科学基金2014A030313531;广东省专业综合改革试点项目生物工程,粤教高函[2013]113 号;广州市科技计划项目201510010108

在线出版日期：2018-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：20-22