多重序列比对Alignment的信息度量准则

摘要：

多重序列的比对(Alignment)的核心问题是对多重DNA(或RNA、蛋白质)序列,寻找它们的相似部分或稳定区域,但如何定义多重序列的相似度(或罚分函数)则是解决多重序列比对的前提.首先对多重序列相似度的合理性进行了讨论,给出了一组合理的相似度所必需具备的条件;再利用Shannon熵的特点,给出一个满足这些合理性条件的多重序列比对的优化准则.

关键词：多重序列比对(Alignment)、多重序列的相似度与罚分函数、信息度量准则

所属期刊栏目：19

分类号：O236(控制论、信息论（数学理论）)

资助基金：刘徽应用数学研究中心资助项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1-10