基于生物信息学方法分析E3泛素连接酶DTL在肝细胞癌中的表达与预后意义

摘要：

目的:探讨E3泛素连接酶DTL(dentideless E3 ubiquitin ligase)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及预后价值.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载获得374例HCC组织和50例癌旁正常组织的转录组数据;从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载GSE121248数据集,获得包括70例HCC组织和37例癌旁正常组织的转录组数据.比较HCC组织与癌旁正常组织中DTL的表达水平.采用Kaplan-Meier法进行生存分析,并采用log-rank检验比较DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者总生存率、无进展间期生存率的差异.HCC患者不良预后的危险因素采用Cox回归分析.绘制DTL表达水平诊断HCC的受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线.利用基于多因素Cox回归分析的列线图预测DTL对HCC患者预后的影响.同时对DTL高表达组与DTL低表达组HCC组织的差异表达基因进行GSEA富集分析.结果:DTL在HCC组织中的表达水平高于癌旁正常组织(P<0.001).DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者年龄、人种、AFP水平、病理分级、病理分期、T分期差异均有统计学意义(P均<0.05).Kaplan-Meier法生存分析结果显示,与DTL低表达组HCC患者相比,DTL高表达组HCC患者总生存率和无进展间期生存率均较短(P=0.005,P<0.001).ROC曲线显示,DTL表达水平对HCC有较强的诊断能力[曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.96].通过构建列线图发现,DTL表达的C指数为0.663(95％CI为0.54～0.61).GSEA富集分析结果显示,DTL可能通过影响细胞周期、染色体维持、DNA复制、G2/M检查点、有丝分裂期、TP53转录调控等通路影响HCC的发生发展.

关键词：DTL、肝细胞癌、预后

所属期刊栏目：9

分类号：R735.2;S813.3;R319

资助基金：中国医学科学院医学与健康科技创新工程2021-1-I2M-050

在线出版日期：2022-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：41-47