华山松高通量全基因组SNP标记开发及其分析
为开发华山松大量的稳定性高、特异性强的SNP标记,本研究以279份华山松针叶为试验材料,利用SLAF-seq技术,测序共获得Reads数据3 169 Mb,SLAF标签12 952 676个,多态性SLAF标签为1 456 486个,SLAF多态性百分率是11.24％,平均测序深度为20.52 x,测序平均Q30为96.58％,平均GC含量为37.76％.且采用水稻'日本晴'的测序数据用于评估试验建库的准确性,结果显示本试验比对效率在97％;且水稻'日本晴'数据的酶切效率在100％,这表明本试验酶切反应也正常.最终从12 952 676个SLAF标签中检测到了 3 469 074个群体SNP标记.这为华山松分子辅助育种、遗传多样性分析和遗传图谱构建等研究提供理论参考.
华山松(Pinus armandii)、SLAF-seq、SNP 位点
20
S565.4;S641.3;S852.65
云南省科技厅科技计划重点研发项目;国家重点研发计划;云南省省级林业科技推广项目
2022-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
5733-5740
