基于RAD-seq简化基因组测序的青皮茄子遗传多样性分析
为了在基因组水平上揭示青皮茄子材料的遗传多样性,发掘重要种质特性基因,本研究采用RAD-seq测序鉴定了国内外49份青皮茄子材料的SNP标记,计算观察杂合度(Ho)、核苷酸多样度(π)、近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)等遗传统计量指标,分析其遗传多样性和群体结构,并通过选择信号检测鉴定受选择基因.结果表明,在49份青皮茄子材料中鉴定SNP标记77 431个,遗传聚类分析将49份青皮茄子材料分为4个群体,POP4和POP2的遗传多样性最为丰富,POP1的遗传多样性相对匮乏;POP4和POP2的近交系数Fis最高,并且群体结构分析结果显示最优分群数为4,类群之间存在相互交叉现象,说明每个类群间有很近的亲缘关系.通过选择信号分析,在49个青皮茄子群体中检测出10个区域受到选择作用,包含144个受选择基因.进一步对这些受选择基因进行了 GO富集分析,在分子功能(Molecular function)、细胞组份(Cellular component)和生物学过程(Biological process)均存在选择性富集.
青皮茄子、RAD-seq、遗传多样性、群体结构
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S511;S831.2;S634.3
上海市科技兴农项目;农业部大宗蔬菜产业技术体系上海综合试验站;上海市农业科学院卓越团队农科创2017B-06;国家重点研发计划
2022-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
5692-5702
