基于ITS序列对青海不同地区中国沙棘遗传变异的分析
为研究青海省不同地区中国沙棘的遗传变异,本研究采集青海省不同地区野生的中国沙棘、西藏沙棘和肋果沙棘叶片作为实验材料,提取沙棘叶片的DNA,对其内转录间隔区(ITS)进行PCR扩增和扩增产物测序检测.对中国沙棘的ITS序列进行同源性和差异性分析,以西藏沙棘和肋果沙棘为外类群构建系统发育树.结果 表明,不同地区中国沙棘ITS序列的同源性很高,均在99.5%以上.聚类分析结果显示中国沙棘、肋果沙棘和西藏沙棘各自分为一组,与形态学分类中归属于三个不同的种的分类结果一致.11个中国沙棘样品的ITS1区序列长度均为307 bp,5.8S区均为167 bp,ITS2区均为264 bp,3个区域分别存在3个、1个和5个变异位点.说明青海省不同地区中国沙棘的ITS区基因发生了不同程度的变异,本研究为进一步研究沙棘ITS基因提供了理论依据.
沙棘;ITS;序列分析;同源性;系统进化树
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本研究由国家自然科学基金;中国科学院-青海省国家公园联合专项三江源国家公园民生改善模式研发及技术集成
2021-11-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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