樟叶越桔过氧化氢酶VdCAT1基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

作为植物抗氧化防御系统的主要保护酶之一,过氧化氢酶在植物细胞响应逆境胁迫应答方面发挥重要作用.本研究通过生物信息学分析RNA-Seq数据(NCBI登录号:PRJNA285946),结合RT-PCR技术首次从樟叶越桔成熟叶片中获得了过氧化氢酶基因VdCAT1全长为1 611bp的cDNA序列,完整开放阅读框(ORF)长度为1 479 bp;推测编码的VdCAT1蛋白含492个氨基酸,相对分子量为56.96 kD,理论等电点(pI)为6.65,总平均疏水系数为-0.545;推测VdCAT1为无跨膜结构域、非分泌性亲水蛋白质.VdCAT1二级结构主要由随机卷曲和α-螺旋等构件组成.樟叶越桔VdCAT1基因编码的氨基酸序列与茶树CsCAT1和拟南芥AtCAT1等过氧化氢酶氨基酸序列具有较高的同源性和较近的亲缘关系.本研究结果为日后揭示VdCAT1基因的生理学功能及其表达调控机制提供科学依据.

关键词：樟叶越桔、过氧化氢酶、VdCAT1基因、生物信息学

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分类号：TS207.4;Q943.2;Q78

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家重点实验室开放基金;国家重点实验室开放基金

在线出版日期：2021-06-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2527-2537