基于转录组测序的黑枣EST-SSR引物开发与鉴定分析

摘要：

目前黑枣己有的分子标记比较匮乏,本研究基于转录组测序技术对黑枣品种进行SSR引物开发,为黑枣种质资源评价及分子标记辅助育种提供有力的技术支持.本研究对'冀洪1号'黑枣转录组序列进行了分析筛选和开发,并利用开发出的引物进行了验证分析.结果表明:共得到52 537个Unigene序列,SSR位点总数22 327个,包含SSR的Unigene序列数为15 286条.黑枣SSR位点的重复单元中,二核苷酸重复类型的SSR最多(52.26％),其次为单核苷酸(25.84％)及三核苷酸(19.25％).随机挑选90对EST-SSR引物进行验证,有效扩增率为77.78％(70对),多态性引物比例为18.57％(13对),对13个多态性位点进一步分析可得,共扩增了35个等位基因,PIC值介于0.233～0.677之间,平均为0.430.本研究开发出的EST-SSR分子标记,为后期进行黑枣良种的鉴别及分子育种提供了分子技术手段.

关键词：黑枣、转录组、EST-SSR、引物

所属期刊栏目：19

分类号：S521.03;S601;S852.65

资助基金：河北农业大学科研发展基金;河北洪崖山冀洪1号无核黑枣乡土树种品种审定项目

在线出版日期：2021-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：200-208