低温胁迫下仁用杏花转录组测序分析

摘要：

为了研究仁用杏花的转录组信息以及寻找室温(CK)和低温处理的仁用杏花的差异表达基因,本试验以抗寒性强的仁用杏品种'围选1号'的花为试验材料,采用高通量转录组测序技术对室温(CK)和低温处理的'围选1号'的花进行转录组测序.测序结果显示,共获得Transcript和Unigene分别为116 957条和31 360条,其中N50分别为2 311 nt和2 262 nt.使用BLAST软件将Transcript序列与NR、GO、Swiss-Prot、KOG和KEGG数据库比对,注释到各数据库的序列分别为84 231条、12 955条、60 914条、50 978条和7 185条.并对CK和低温处理的样品之间表达量方差最大的前50个基因做聚类分析,结果分为两大类,第一类有12个基因,在CK中表达量较高,在低温处理中表达量较低;第二类有38个基因,在低温处理中表达量较高,在CK中表达量较低.此研究结果获得了仁用杏花的转录信息,并寻找到了室温(CK)和低温处理的仁用杏花的差异表达基因,为今后采取基因工程手段培育抗寒的仁用杏新品种提供了基因资源.

关键词：仁用杏花、转录组测序、低温胁迫

所属期刊栏目：18

分类号：S642.2;Q95-33;S513

资助基金：河北省科技计划;河北省科技计划;国家自然科学基金

在线出版日期：2020-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：6274-6279