基于高通量测序的枣疯病转录组分析
为了研究枣树枣疯病发生的分子机理,基于边合成边测序技术,本研究使用Illumina高通量测序平台对健康及感病的木枣树叶片进行转录组测序分析.经过测序质量控制,共得到Clean Data 55.17 Gb,各样品Clean Data平均为6.13 Gb,GC％含量为45.43％,Q30>93.63％,与参考基因组的比对效率在78.41％～85.77％之间,共发掘1909个新基因.样品间共筛选出9593个差异表达基因,其中上调基因有6199个,下调基因有3394个.同时,还预测出1298个转录因子,归于55类转录因子,其中AP2-EREBP家族、MYB家族、bHLH家族和C2H2家族最多,分别有112个、90个、90个和85个.健康木枣与感病木枣(ML vs.WL)注释到各数据库的差异表达基因数(4755)明显多于其它两个样品组.各样品组间差异表达基因显著富集在黄酮类化合物、苯丙烷类化合物和不饱和脂肪酸生物合成途径,以及植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢和脂肪酸代谢等代谢通路.该转录组测序分析为寻找枣疯病相关基因提供理论参考.
枣疯病、转录组、高通量测序、差异表达基因
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本研究由陕西省教育厅重点实验室项目;延安大学博士科研启动项目;国家自然科学基金
2021-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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