露地菊(Chrysanthemum×grandiflora) CgDREB基因克隆和生物信息学分析
DREB转录因子在植物抗逆过程中起关键性作用,它可以激活一系列抗逆功能基因的表达从而综合提高植物的抗逆性.为探究露地菊DREB基因的功能,本研究通过结合RNA-Seq和RT-PCR技术从露地菊‘纽9717’中克隆得到CgDREB基因,并对该基因及其蛋白进行生物信息学和表达模式分析.结果 显示,CgDREB基因ORF全长450 bp,编码149个氨基酸,预测蛋白相对分子量16.742 kD,理论等电点9.32,为亲水性蛋白,没有跨膜结构,无信号肽.功能结构域分析表明其具有一个高度保守的AP2/ERF结构域.同源性分析其属于AP2/ERF转录因子家族DREB亚组A-5组.蛋白质二级结构中无规则卷曲占57.05％,α-螺旋占28.86％,延伸链占10.07％,β-转角占4.03％.三级结构显示其以单体蛋白结构存在.RT-qPCR分析表明,高盐、干旱、低温和ABA均能诱导CgDREB基因的表达.本研究为深入了解露地菊A-5组DREB转录因子及其抗逆调控机制提供基础,为露地菊品种改良提供理论依据.
露地菊、DREB、基因克隆
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Q785;S512.1;S852.65
国家自然科学基金31870687
2020-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
780-788
