白三叶质子焦磷酸酶基因TrVP1生物信息学分析及定量表达
质子焦磷酸酶(H+>-PPase)在提高植物抗逆性方面发挥着重要的作用.本试验以白三叶品种”拉丁诺”(Trifolium repens cv.”Ladino”)c DNA为模板克隆出了白三叶H+-PPase基因TrVP1的全长序列,并利用相关分析软件和网站对其进行生物信息学分析,并研究它在非生物胁迫及信号物质诱导下的表达模式.结果表明,TrVP1全长为2 594 bp,开放阅读框(ORF)为2 304 bp,共编码767个氨基酸;其编码蛋白为亲水性跨膜蛋白,分子量80.49 k D,等电点p I 5.18,多序列比对及系统进化树分析显示该基因属于Ⅰ型VP家族.采用荧光定量(qRT-PCR)方法分析TrVP1的表达模式发现,重金属(CdSO4)、低温(4℃)、高温(35℃)、干旱(PEG-6000)和盐(NaCl)胁迫均显著上调了白三叶根系中TrVP1的表达量,但下调了叶片中TrVP1的表达量.此外,白三叶根系中TrVP1的表达受到Ca2+信号的显著诱导,而叶片中的TrVP1表达则受到抑制.与此同时,NO和H2O2信号对白三叶根系和叶片中TrVP1的表达均起到抑制作用.本试验为深入研究质子焦磷酸化酶基因,提高白三叶抗逆性的功能及其应用提供了理论依据.
白三叶、氢离子焦磷酸化酶、基因克隆、信息学分析、定量表达
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国家自然科学基金NSFC31372371
2018-10-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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