山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析
在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶.依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORF的LACS基因,其长度为2 360~2 900 bp,编码氨基酸为654~730 aa.开展LACS蛋白保守域及进化树分析,确定了山杏LACS具有AMP绑定域,说明其在物种间的高度保守性.同时,对不同发育期山杏杏仁的LACS基因开展qRT-PCR表达谱分析.为探究杏仁发育过程中油脂的累积模式,以山杏为试材,采用索氏提取法对其油脂含量进行测定,确定杏仁油的主要累积期在20~50 DAF.结合油脂含量的检测结果,对蛋白互作网络和基因表达等方面加以分析,确定山杏LACS9与油脂累积密切相关.本研究结果可为后续探究LACS基因家族在山杏杏仁发育及油脂累积中的调控机制奠定基础.
山杏、长链酰基辅酶A合成酶、生物信息学分析、qRT-PCR分析
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海南大学科研基金资助项目No.KYQD
2018-06-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
1977-1984