植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析

摘要：

精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义.为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达.首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因.对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因.人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早.拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失.ADC基因在植物登陆后才得以进化形成.DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制.

关键词：鸟氨酸脱羧酶、精氨酸脱羧酶、基因家族、进化

所属期刊栏目：16

分类号：Q943.2;S511;S601

资助基金：基本科研业务费项目;基本科研业务费项目

在线出版日期：2018-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：96-101