蒺藜苜蓿PEPC蛋白生物信息学分析及在碱胁迫中功能的预测
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)是一种广泛存在于自然界中的代谢酶,在高等植物中参与光合作用的碳固定、生物合成前体的供应、pH的调控等多种生物学过程.本研究通过生物信息学方法,识别、筛选、获得蒺藜苜蓿(Medicago truncatula) PEPC (MtPEPC)的氨基酸序列Medtr2g076670.2,并对与Medtr2g076670.2相似的25个豆科PEPC基因进行系统进化树分析.着重对4个MtPEPCs和6个GmPEPCs基因进行功能域分析、蛋白二级结构域预测及组织表达特异性分析,以推测蒺藜苜蓿PEPC基因的功能.结果表明,该10个基因分为两个Group分支,两个分支中存在不同的亚细胞定位信号,并且两个分支中大豆基因在地上和地下组织之间存在差异.通过蛋白相互作用的预测分析,PEPC蛋白可与苹果酸脱氢酶(malate dehydrogenase,MDH)、丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)及2个未知蛋白存在相互作用;在碱胁迫下,GsPEPCs基因与苹果酸脱氢酶基因是“共表达”基因.可以推测,PEPC对碱胁迫的反应,可能是通过调节有机酸含量实现的.通过对MtPEPC蛋白和GmPEPC蛋白的生物信息学分析,获得了其相应的分子生物学特征,为PEPC蛋白在碱胁迫反应中的功能提供理论依据.
蒺藜苜蓿、大豆、PEPC、生物信息学、碱胁迫
14
S511.01;Q943.2;Q78
国家自然科学基金;黑龙江省自然科学基金
2016-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
344-351
