一年生辣椒(Cpsicum annuum L.)与中华辣椒(Cpsicum chinense Jacquin)DNA甲基化多样性分析
本研究调查了一年生辣椒和中华辣椒种的DNA甲基化多样性.选取了24个一年生辣椒栽培种和6个中华辣椒栽培种作为研究对象,采用MSAP (methylation-sensitive amplification polymorphism)技术对其基因组CCGG位点的甲基化多样性进行了分析.结果表明,从63对MSAP引物中筛选出5对重复性好、条带清晰的引物对,对30份辣椒种质基因组DNA进行MSAP扩增,得到939条带谱,其中多态性条带937个,多态性比例高达99.79％.DNA甲基化模式分析表明,类型Ⅰ为非甲基化带型(3721),类型Ⅱ为半甲基化带型(3152),类型Ⅲ为全甲基化带型(3839),辣椒甲基化模式主要以全甲基化为主,一年生辣椒(Capsicumannuum L.)和中华辣椒(Capsicum chinense Jacquin)甲基化条带平均分别为319和217,其扩增位点的甲基化率分别77.24％和63.64％,差异达极显著水平.基于相似性系数的UPGMA法聚类分析,在0.68相似水平可以将30个种质分为3个类,第1类:No.10～No.13和No.15共5个种质,其中No.10为一年生辣椒,其它4个为中华辣椒;第2类:No.2～No.9、No.14、No.16～No.30,其中No.14和No.17为中华辣椒;第3类:只有No.1,为一年生辣椒.应用MSAP未能将一年生辣椒和中华辣椒区分开来,表明辣椒表观遗传十分丰富.Nei's基因多态性指数(h)和Shannon信息指数(D在2个栽培种中分别为0.204 0和0.329 8、0.1864和0.297 5,一年生辣椒的表观遗传多样性稍高于中华辣椒.DNA甲基化多样性作为标志遗传多样性的一种信号源,本研究结果为深入探讨辣椒种群分化及物种进化奠定了基础.
辣椒、表观遗传多样性、DNA甲基化、MSAP
12
农业部948项目2012-Z55;广东省科技计划项目2010B020304001;广东省农科院院长基金项目201108;国家大宗蔬菜产业技术体系广州综合试验站2012B061800053
2014-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
306-315
