成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库的构建与EST分析

摘要：

以苦瓜(Momordica charantia L.)1/4黄期果实为材料,采用DSN (duplex-specific nuclease)均一化与SMART (switching mechanism at 5' end of RNA transcript)技术相结合,构建成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库.经检测,该文库的转化效率为3600000个菌落/μL连接产物,其平均插入片段大小为1.4 kb,重组率为98.0%,表明文库质量较好.随机挑取768个克隆进行EST测序,获得有607个高质量的EST,其中17个contig和562个singleton.冗余率为7.41%,文库的全长率67%.对测序结果进行注释和归类分析表明,已知功能基因大部分与催化活性、蛋白结合、转录调节活性、转运活性和酶调控活性有关分析,结果表明文库的可靠性好.发现有若干个与胞内蛋白质降解、细胞壁代谢、乙烯合成、信号传导和抗逆等可能与苦瓜果实成熟软化相关的新基因.

关键词：苦瓜(Momordica charantia L.)、果实成熟软化、均一化、cDNA文库、EST

在线出版日期：2013-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：211-216