甘蓝型油菜BnPPR636及其启动子的克隆与表达分析

摘要：

PPR蛋白对植物的生长发育、逆境抗性以及育性具有重要的调节作用.本研究根据氨基酸序列的保守性,利用CODEHOP方法,通过简并引物扩增甘蓝型油菜基因组DNA,得到PPR基因片段.结合RACE技术,在甘蓝型油菜品系120中扩增得到了PPR基因cDNA的全长序列.分析发现该PPR基因编码一个含636个氨基酸的蛋白质,具有11个PPR基序,不含有内含子,具有典型的PPR基因特征,命名为BnPPR636.Blast比对发现,BnPPR636与白菜P2克隆的一个未知蛋白的氨基酸序列一致性最高,达到75％.RT-PCR分析表明,BnPPR636在花中的表达量最高,在根与角果中的表达量次之,叶和茎中较低.进化树分析表明,BnPPR636蛋白与其他植物中和CMS育性恢复有关的PPR蛋白序列的一致性较高.以基因组DNA为模板,利用染色体步移技术,得到了BnPPR636基因起始密码子上游1 145 bp的DNA片段.经生物信息学软件分析表明,该序列具有典型的启动子序列特征,并含有许多相关的顺式作用元件,可能参与调节花和根的发育.

关键词：油菜、同源克隆、PPR基因、CODEHOP、RACE、染色体步移

所属期刊栏目：10

分类号：R69;R61

资助基金：国家863计划课题2011AA10A104;国家支撑计划课题2011BAD35B04;湖北省研究与开发项目2011-2015

在线出版日期：2013-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：693-700