胚胎植入前染色体非整倍体检测试剂盒评价

摘要：

目的 使用胚胎植入前染色体非整倍体国家参考品,评价胚胎植入前染色体非整倍体检测试剂盒(半导体测序法)的性能.方法 取国家参考品进行细胞裂解及片段化,制备文库,进行文库的扩增和单细胞扩增后纯化.将纯化的单细胞扩增DNA片段化和纯化后,进行末端修复、加上接头以及PCR扩增等步骤,构建文库.将文库纯化后进行定量.使用基因测序仪BioelectronSeq 4000进行测序.使用试剂盒配套的全自动分析软件对测序数据进行信息分析,报告样本的染色体异常情况.结果 对于65个异常片段大于4 Mb的国家阳性参考品,试剂盒均能检出对应的染色体异常,检出率为100％;国家阳性参考品19-del(7)-25.3 M在7号染色体100.5 Mb-125.8 Mb位置存在片段大小约25.3 Mb的拷贝数缺失,Z-score为-28.6,其他国家阳性参考品的相应异常区域对应的染色体Z-score均>3或<-3.对于15个异常片段小于等于4 Mb的国家阳性参考品,对应的染色体异常检出率为86.7％(13/15);国家阳性参考品22-del(7)-1.5 M在7号染色体72.1 Mb-73.6 Mb位置存在片段大小约1.5 Mb的拷贝数缺失,其Z-score为-8.1.国家阳性参考品30-dup(17)-1.9M的17号染色体Z-score为2.0,未检测到相应异常区域,国家阳性参考品100-NC4-dup(Xq12)-1.4M的X染色体Z-score为1.1,未检测到相应异常区域,其他13个国家阳性参考品的相应异常区域对应的染色体Z-score均>3或<-3.10个国家阴性参考品均未检出试剂盒范围内的染色体异常,其Z-score均小于3且大于0,显著性水平P-value>0.0001;如国家阴性参考品97-NC1在1-22号染色体和性染色体区域内均未检测出异常区域.对30％嵌合的嵌合体样本检出率为50％(3/6),相对应的70％嵌合体样本检出率为83.3％(5/6);国家嵌合体参考品110-0.3-del(4)-37.7M中,30％嵌合比例细胞在4号染色体153.1 Mb-190.8 Mb位置存在大小约37.7 Mb拷贝数缺失,其Z-score为-16.5;70％嵌合比例细胞的在15号染色体23.6 Mb-28.5 Mb位置存在大小约4.9 Mb拷贝数缺失,其Z-score为-10.5,结果显示30％嵌合和70％嵌合的细胞均正确检出.结论 胚胎植入前染色体非整倍体检测试剂盒能够符合胚胎植入前染色体非整倍体国家参考品的要求.

关键词：胚胎植入前非整倍体筛查、胚胎植入前遗传学筛查、单细胞扩增、非整倍体、嵌合体、高通量测序

所属期刊栏目：14

分类号：R446.1;R373.3;R714.51

在线出版日期：2022-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1104-1108