10.3969/j.issn.1674-6929.2021.11.008
基于生物信息学分析ESPL1基因在肺腺癌中表达与突变的临床意义
目的 研究ESPL1在肺腺癌中的表达及突变情况,探索ESPL1在肺腺癌中的预后价值及生物学功能.方法 TCGA数据库中下载并整理肺腺癌中ESPL1基因表达数据及患者的临床病理信息,比较ESPL1在肺腺癌与正常组织中的表达差异.通过cBioportal分析ESPL1基因突变率及突变患者的预后情况.Kaplan-Meier法分析ESPL1表达对患者预后的影响并利用GEPIA与Kaplan Meier-plotter在线工具对此进行验证.通过COX回归分析ESPL1表达与肺腺癌患者临床预后相关性,用STRING数据库探索与ESPL1共表达的蛋白互作网络.利用GSEA富集分析预测ESPL1在肺腺癌中参与的分子通路.结果 ESPL1表达在肺腺癌中显著上调(P<0.05),ESPL1在TCGA数据库样本中突变率为1.6%且突变组患者生存率显著降低,差异有统计学意义(P<0.05).ESPL1高表达组患者的总体生存率低于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05).ESPL1的表达水平与stage分期及远处转移显著相关(P<0.05),是肺腺癌预后的独立危险因素(HR=1.122,95%CI:1.014~1.241,P<0.05).富集分析结果显示ESPL1主要富集在细胞周期、碱基切除修复及Wnt信号通路等.结论 ESPL1在肺腺癌患者中高表达并具有一定突变率,可参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展并影响其预后,ESPL1有望成为评价肺腺癌预后及治疗靶点.
ESPL1;肺腺癌;TCGA;预后;临床意义
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国家自然科学基金;湖北省卫生健康科研基金资助;武汉市应用基础研究;湖北省卫生和计划生育委员会联合基金项目;湖北省卫生和计划生育委员会青年人才项目;武汉大学中南医院科技创新培育基金;武汉大学大学生创新项目
2021-12-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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