鲍曼不动杆菌LpxC的同源模建及分子对接

摘要：

鲍曼不动杆菌已成为最普遍的医院致病菌,且耐药情况严峻.LpxC作为新抗菌药物靶点被大量研究,但鲍曼不动杆菌LpxC晶体尚未解析得到,基于其结构的药物设计等工作无法开展.以铜绿假单胞菌LpxC晶体结构为模板,通过同源模建方法获得鲍曼不动杆菌LpxC结构模型.较好的Ramachandran plot分布和Profile-3D结果验证了模型的合理性.用分子动力学模拟优化鲍曼不动杆菌LpxC模型,修补部分不合理构象.后续分子对接结果显示S构型的苄氧乙酰基羟肟酸类抑制剂比R构型分子能更有效地结合在F191,H237和K238组成的较浅口袋中,这可能是S构型抑制剂活性更高的主要因素,模拟结果与实验数据吻合较好.

关键词：鲍曼不动杆菌、LpxC、同源模建、分子对接、分子动力学模拟

所属期刊栏目：33

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目11247018;四川省教育厅科研重点资助项目12ZA066;乐山市科技计划项目14SZD018.

在线出版日期：2017-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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