枯草芽孢杆菌代谢组样品前处理方法的比较研究

摘要：

本研究比较了不同淬灭剂(甲醇、60％甲醇、60％甲醇-0.9％ NaCl、60％甲醇-0.9％(NH4)2CO3和60％甲醇-0.9％ NaAc)条件下胞内物质核酸、蛋白质和代谢物的渗漏情况,发现60％甲醇-0.9％(NH4) 2CO3和60％甲醇-0.9％ NaAc渗漏最少;比较了珠磨法、液氮研磨法、超声破碎3种细胞破碎方法条件下代谢物的提取效果,发现珠磨法提取效果最佳;比较了不同衍生时间(0.5～2.5 h)下代谢物相对丰度的变化,发现衍生时间达到2.0h后,代谢物丰度不再有显著变化.最终确定了枯草芽孢杆菌代谢组样品最适前处理方法:预冷的60％甲醇-0.9％ (NH4)2CO3淬灭,珠磨法破碎细胞,细胞破碎物用O-Bis[三甲基硅烷]三氟乙酸盐(MSTFA)衍生2h.采用本方法从枯草芽孢杆菌中共鉴定到223种代谢物,包括大量氨基酸、有机酸和糖类物质.本研究为枯草芽孢杆菌的代谢组学研究提供了基础.

关键词：代谢组学、枯草芽孢杆菌、气相色谱-质谱联用、前处理

所属期刊栏目：43

分类号：X59;R11

资助基金：863计划项目2013BAD10B01-5;国家自然科学基金项目21306140;the National High Technology Research and Development Program of China011AA100905-4;the National Natural Science Foundation of China31370076

在线出版日期：2015-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1169-1174