光谱法及分子模拟法研究杨梅素与ct-DNA的相互作用

摘要：

采用紫外光谱、荧光光谱结合亚甲基蓝荧光探针(MB)、圆二色谱(CD)以及分子模拟等技术研究了生理条件下杨梅素与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,探索了其可能的结合位点与作用机制.热力学参数显示△H＜0、△S ＜0,说明杨梅素与ct-DNA通过氢键和范德华力发生相互作用.光谱研究显示,ct-DNA能够猝灭杨梅素的内源荧光,猝灭方式为静态猝灭,两者的结合常数为1.86×103 mol",结合位点数为1.在竞争性实验中杨梅素未能将MB从MB-DNA复合体系中游离出来,说明其与ct-DNA的作用方式为沟槽结合.圆二色光谱研究表明,杨梅素的加入未能破坏ct-DNA的双螺旋结构,两者的作用方式为沟槽结合.进一步通过分子模拟研究得到杨梅素与DNA结合的最低能量构象,杨梅素A环7-O和B环3'-O分别与DNA的碱基DA18和DA6在边缘小沟处通过氢键结合,周围富含碱基A和T,与光谱学研究结果一致,结合距离分别为2.061 A和1.918 A.

关键词：杨梅素、小牛胸腺DNA (ct-DNA)、沟槽结合、光谱法、分子模拟

所属期刊栏目：34

分类号：O657.3;Q523(分析化学)

在线出版日期：2015-12-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1233-1239