应用SELDI-TOF-MS技术分析VKC泪液的差异表达蛋白

摘要：

目的 探讨用蛋白质芯片技术筛选春季卡他性结膜炎(vernal keratoconjunctivis,VKC)患者泪液中蛋白质表达谱,寻找泪液中的标志性蛋白.方法 采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),运用CM10蛋白质芯片检测66例VKC患者和62例正常对照组泪液中蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用Biomarker Wizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(support vector machines,SVM)方法建立并测试VKC患者泪液中的蛋白质指纹图谱模型.结果 在芯片上捕获到145种蛋白质,用质谱仪筛选出VKC患者与正常对照组相比的23种差异蛋白,从中再次筛选出3种蛋白质组成VKC的蛋白质谱最优化模型,VKC患者泪液中质荷比(m/z)分别为2024.3,6630.2和8598.9的3种蛋白质表达上调.模型经三倍交叉验证后用盲法测定,其敏感性和特异性分别为90.91%和93.55%,阳性预测值为93.75%.结论 蛋白质芯片技术可快速、有效地筛选出VKC患者泪液差异蛋白,结合SVM可建立一个由3种蛋白质组成的蛋白质指纹图谱模型,可对VKC做很好的诊断预测,对这3种蛋白质尤其是m/z为2024.8的蛋白质进行研究,有助于VKC病因学进展及诊断标记物的发现.

关键词：蛋白芯片、春季卡他性结膜炎、生物标志物

所属期刊栏目：25

分类号：R73;R37

在线出版日期：2012-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：307-310