油茶闽43叶绿体基因组序列特征及其近缘物种亲缘关系分析

摘要：

为了探究油茶闽43与山茶属近缘物种间叶绿体基因组的差异以及进化关系,利用基因组学分析方法,对油茶闽43与其他近缘山茶属物种叶绿体基因组进行比较分析.叶绿体基因组结构特征分析结果显示:9种山茶属物种的叶绿体基因组大小为156 902～157 567 bp,有130～136个基因.REPuter分析发现,这9种山茶属物种的长重复序列类型均为P和F,通过MISA软件确定9种山茶属物种的SSR数量为52～71个,其中闽43的SSR数量为65个.通过IR边界分析,白毛茶和油茶闽43与其他3种属内物种的边界基因有较为明显差异,同时通过核苷酸多态性分析,检测出叶绿体基因组共有5个高变区,分别为psbK～atpA、rpoB～psbD、rps4～ndhJ、ycf1、ndhF～rps12～exon1.并从系统发育树的结果得出,油茶闽43与落瓣油茶的亲缘关系最近.该研究可为普通油茶种群遗传结构提供基础,为提高普通油茶的产油量以及优良品种的选育提供理论依据.

关键词：油茶、叶绿体基因组、长重复序列、系统发育树

所属期刊栏目：54

分类号：S794.4(森林树种)

资助基金：福建省种业创新与产业化工程项目ZYCX-LY202103

在线出版日期：2023-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：9-17