基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性

摘要：

烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂.该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益.解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义.因此,收集了患烂皮病棘胸蛙的健康和溃烂部位的皮肤样本,采用细菌16sRNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,挖掘烂皮病棘胸蛙的溃烂皮肤中的细菌结构特征.结果显示,溃烂皮肤中细菌的丰度和多样性均显著低于健康皮肤.在门分类水平上,溃烂皮肤的优势菌门是变形菌门Proteobacteria,而健康皮肤的优势菌门是蓝细菌门/叶绿体Cyanobacteria Chloroplast、变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria.在属分类水平上,溃烂皮肤的优势菌属为不动杆菌属Acinetobacter,健康皮肤中的优势菌属为链形植物属Streptophyta、不动杆菌属.不动杆菌属虽然为健康皮肤和患病皮肤的共有属,但是溃烂皮肤中的不动杆菌属的含量显著高于健康皮肤.研究结果解析了患烂皮病棘胸蛙的皮肤中可能的致病细菌,对于棘胸蛙养殖过程中的病害防治有重要的指导意义.

关键词：棘胸蛙、烂皮病、皮肤、高通量测序、菌群结构

所属期刊栏目：53

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：福建省科技厅高校产学合作项目2021N5003

在线出版日期：2023-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1-9