金鱼源维氏气单胞菌JY01全基因组测序及生物信息分析

摘要：

维氏气单胞菌(Aeromonasveronii JY01)是从福州某养殖场内金鱼烂尾、腐皮和溃疡等病灶处分离出的1株革兰氏阴性优势菌.为了解其基因组结构及功能特征,基于IlluminaPE150和Pacbio测序平台对维氏气单肥菌菌株JY01进行全基因组测序,并对测序数据进行组装和组分分析,利用生物信息学手段进行基因预测与功能注释、同时预测致病因子和耐药基因.结果 表明:维氏气单肥菌菌株JY01基因组序列长度为4.97 Mb,GC含量为58.17％;共预测到4601个编码基因、31个rRNA、16个基因岛及124个tRNA;其中,3461个基因在COG中获得注释,3082个基因聚集到GO聚类分析中,4345个基因在KEGG代谢通路中富集,预测维氏气单胞菌菌株JY01携带13种毒力因子包含240个相关毒力基因及9大类抗生素耐药性包含175个抗生素耐药基因.

关键词：金鱼;维氏气单胞菌;全基因组测序;基因注释

所属期刊栏目：52

分类号：S943(水产保护学)

资助基金：福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项;福建省渔业结构调整专项资金资助项目;福建省农业科学院名优水产健康养殖技术集成与示范推广

在线出版日期：2021-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：18-25