乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞MicroRNAs表达谱的差异性分析

摘要：

背景与目的:已有研究表明,MicmRNAs(miRNAs)的异常表达参与了乳腺癌的发生和发展,常起到抑癌基因或癌基因作用.本研究旨在探讨乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异性表达,并预测异常表达的miRNAs可能调控的靶基因.方法:培养乳腺癌细胞株MCF-7和正常乳腺上皮细胞株HBL-100,分别提取细胞总RNA,并进行质检;利用miRNAs芯片技术,检测乳腺癌细胞和正常乳腺上皮细胞miRNAs的表达,对其表达谱进行差异性分析;采用实时定量RT-PCR进行验证;运用MiRanda、TargetScan、PicTar、DIANA-microT软件预测miRNAs可能调控的靶基因.结果:从MCF-7细胞与HBL-100细胞提取到的总RNA纯度较高,其A260/A280为1.90,A260/A230为2.0;琼脂糖凝胶实验结果显示总RNA完整性好.通过miRNAs表达谱的差异性分析,获得173个与乳腺癌相关的miRNAs,其中113个表达上调,60个表达下调;实时定量PCR检测到mir-18a和mlr-195在MCF-7细胞中高表达;对乳腺癌细胞显著异常表达的mir-200b进行信息学分析,共筛选出68个靶基因.结论:获得了乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异表达谱,其中部分miRNAs可能通过调控其靶基因而参与乳腺癌的发病机制.

关键词：乳腺肿瘤、MCF-7细胞、miRNA、表达谱、差异性分析

所属期刊栏目：28

分类号：R394-33;R394.3;R737.9

资助基金：上海高校选拔培养优秀青年教师科研专项基金项目Szy-07031;上海市教育委员会科研创新项目09YZ122,08YZ54;上海市教委E-研究院中医内科建设计划基金资助项目E03008

在线出版日期：2013-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：493-499