鼠源抑癌新基因 Ndr2的克隆、测序与生物信息学分析

摘要：

背景与目的:人源 Ndr2(N-myc down-stream regulator 2)基因是本室于 1999年从正常人全脑 cDNA文库中克隆到的一个新基因 [GenBank, AF159092].初步实验表明, Ndr2有可能是一个抑癌基因.为进一步研究该基因的功能,我们拟克隆小鼠的 Ndr2的基因组序列.方法:以小鼠的基因组文库为模板,采用 RT-PCR方法扩增 Ndr2基因的基因组片段,用 310 Genetic Analyzer自动测序仪测序, GenBank BLAST相似性分析其与人源 Ndr2基因同源性, Pc Gene和 ORF Finder作读框分析, ProDom软件作结构域分析.结果:经琼脂糖 DNA电泳鉴定,获得一约 3 310 bp大小的特异条带,并克隆入 pMD18-T载体. BLAST相似性分析结果表明该序列与人源 Ndr2基因高度同源 (同源性为 91.4% ),与鼠基因组数据库无同源性.已公布的鼠源 Ndr2 mRNA序列比较发现该基因有 8个外显子, 7个内含子.读框分析表明,该序列编码含 200个氨基酸的蛋白质. ProDom软件分析发现其含有酰基携带蛋白( ACP)样结构域.结论:本研究克隆了一个鼠的 Ndr2基因并已测序.该基因为一新基因,该序列已被 GenBank收录 (登录号: AY151387).

关键词：基因、Ndr2、克隆、生物信息学

所属期刊栏目：22

分类号：R739.41(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金39825113

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：230-234