化学因素对基于DNA折纸界面上的核酸适配体与凝血酶相互作用影响的研究

摘要：

核酸适配体(aptamer)与DNA折纸都是由DNA分子折叠而成,两者具有得天独厚的相似性与相容性.本文将aptamer修饰在DNA折纸界面预先设定的位置上,通过原子力显微镜成像手段,在单分子水平上研究了化学因素对DNA折纸界面上的aptamer与凝血酶(thrombin)反应的影响.实验结果表明:修饰固定在DNA折纸界面上的aptamer与thrombin间的结合能力与缓冲液、某些金属离子及其浓度相关,发现HEPES缓冲液是一种比较适合基于DNA折纸的aptamer与thrombin反应的化学反应环境,在此缓冲体系中加入一定浓度的Mg2+和K+是保持反应体系稳定性及其DNA空间构型的有效途径.该研究结果有助于加深对aptamer的三维结构以及与靶分子间的对应识别关系的理解,对DNA折纸与aptamer在生物分子识别的研究和应用方面将起到一定的借鉴作用.

关键词：原子力显微镜、DNA折纸、核酸适配体、凝血酶、化学因素

所属期刊栏目：32

分类号：Q52;Q75;Q336;TG115.21+5.7(核酸)

资助基金：国家科技部973项目2012CB932600,2013CB932801;国家自然科学基金资助项目21073222,11074137;中国科学院知识创新工程重要方向资助项目KJCX2-EW-N03

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：144-149