10.3969/j.issn.1674-6236.2011.21.011
基才隐马尔可夫模型的蛋白质序列筛选算法
对蛋白质序列筛选算法进行了研究,针对蛋白质数据库中存在大量的冗余序列,提出了一种基于隐马尔可夫模型的蛋白质序列筛选算法。详细阐述了在蛋白质数据库中如何建立隐马尔可夫模型。对模型中主要参数的求解和估计给出了主要计算公式。然后利用所建立的模型对蛋白质数据库进行的序列筛选测试,测试结果表明本文设计的算法对同源蛋白质序列筛选精度达到了95%以上。
蛋白质序列、隐马尔可夫模型、筛选、冗余、同源
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TP301.6;TP18(计算技术、计算机技术)
四川省教育厅资助科研项目07ZC009;成都医学院校级科研项目CTZ10-022
2012-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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