外显子跳跃模式中组蛋白修饰的组合模式分析

摘要：

可变剪接是基因表达调控的重要过程.组蛋白修饰参与了可变剪接,但具体调控机制尚不清楚.为了研究组蛋白修饰与可变剪接的关系,首先基于人胚肺成纤维细胞系的RNA-Seq数据,获得了该细胞系外显子跳跃模式的可变剪接数据.在此基础上,分析了外显子跳跃模式中排除和包含外显子中组蛋白修饰间的相关性.通过构建组蛋白修饰间的贝叶斯网络,推断了人胚肺成纤维细胞系外显子跳跃可变剪接事件中组蛋白修饰之间的因果关系.

关键词：可变剪接、贝叶斯网络、外显子跳跃、组蛋白修饰

所属期刊栏目：51

分类号：TP391;Q811.4(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金31771471

在线出版日期：2022-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：668-674