肿瘤免疫微环境中免疫细胞间通讯景观探究

摘要：

肿瘤免疫微环境(TIME)内细胞间通讯为肿瘤发生发展提供了重要的微环境,但目前单细胞相关研究多关注免疫细胞与肿瘤之间的通讯,对不同免疫细胞间的信号交流研究较少.由此收集11套CD45+细胞的单细胞测序数据,推测出TIME中不同免疫细胞间的信号通讯网络.结果发现,肿瘤样本中免疫细胞间的交流更加频繁与密切,进一步分析得到12条与肿瘤相关的差异信号通讯关系,主要包括各种趋化因子?趋化因子受体信号、白介素?白介素受体信号以及Notch通路信号.这些通讯信号关系及其下游转录因子与肿瘤发生发展密切相关.此外,发现部分关键转录因子与各种肿瘤的预后显著相关.最后,通过构建TIME中不同免疫细胞间存在的细胞间通讯全局景观,挖掘出肿瘤中特异及缺失的免疫细胞间通讯关系,为理解TIME中免疫系统调控及肿瘤发展机制提供了线索,也为肿瘤的临床诊疗研究提供了新的设计思路.

关键词：免疫细胞、细胞间通讯、单细胞测序、肿瘤免疫微环境

所属期刊栏目：51

分类号：TP391;R73(计算技术、计算机技术)

资助基金：广东省基础与应用基础研究基金2019A1515110701

在线出版日期：2022-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：176-183