基于双层耦合网的表型-基因关联分析与预测

摘要：

随着基因组测序完成和基因技术不断发展,使得某些疾病的致病基因逐渐得到确认.目前,通过科学实验已经掌握了一部分疾病的致病原因,但是大部分疾病的致病原因,特别是与基因相关的疾病的致病原因还不得而知.该文采用与人类同源相似度高达85％的小鼠数据作为研究对象,使用疾病表型数据集、致病基因数据集和已经确认的表型-基因关联关系数据集构成一个双层耦合网络,通过元路径上随机游走的方法进行数据的分析与挖掘,在已经确认的表型-基因关联数据基础上预测未确定的表型-基因关联关系.经验证比较,该文提出的算法所取得的预测效果优于其他算法.

关键词：关联关系、疾病表型、双层耦合网络、致病基因

所属期刊栏目：49

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金;云南省教育厅科研项目;云南省数据驱动软件工程创新团队

在线出版日期：2020-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：438-444