细菌σ54启动子序列分析与预测

摘要：

对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析，获得两个保守的区域?24区域和?12区域，均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数，引入伪计数构建位置权重矩阵，对168条σ54启动子进行预测，分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验，整体准确度达到82.0%，为σ54启动子的理论和实验研究提供新信息。

关键词：细菌、保守性、位置权重矩阵、启动子

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金61202256,61301260,61100092；中央高校基本科研业务费ZYGX2012J113, ZYGX2013J102

在线出版日期：2015-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：147-149